Seit 2014 besteht die Patenschaft zwischen dem Märkischen Jugendsinfonieorchester und der Philharmonie Südwestfalen.
Alle zwei Jahre gibt es ein gemeinsames Konzert, bei dem die Jugendlichen Seite an Seite mit den Profis der Philharmonie Südwestfalen spielen. Das erste Konzert gab es im Sommer 2017 in der Siegerlandhalle in Siegen, wo u.a. Auszüge aus Prokofjews „Romeo und Julia“ und die Reformationssinfonie von Graun gemeinsam auf die Bühne gebracht wurden.
Im Januar 2019 spielten die Orchester dann Paul Dukas „Zauberlehrling“ und die Rosenkavalier-Suite von Richard Strauss. Zwischendurch wird das MJO von den Profis der Philharmonie bei Probenphasen unterstützt. Auch die Organisationseinheiten der Orchester unterstützen sich bspw. beim Notenrepertoire oder dem gegenseitigen Ausleihen von technischem Equipment.